IDENTIFIKASI BAKTERI ENDOFIT BUAH TIN (Ficus carica L.) YANG BERPOTENSI SEBAGAI ANTIBAKTERI DENGAN ANALISIS METAGENOMIK DAN GEN PENANDA 16S rRNA

Buah tin menjadi sumber penting senyawa bioaktif seperti flavonoid, benzaldehida, alkaloid, terpenoid, dan fenol yang bersifat antibakteri. Buah tin sebagai sumber flavonoid memiliki aktivitas antibakteri tidak terlepas dari peranan bakteri endofit yang berkoloni pada jaringan internal tanaman buah tin. Mempelajari keragaman mikroorganisme termasuk bakteri endofit tidaklah mudah karena 99% mikroorganisme yang ada di lingkungan merupakan jenis yang tidak dapat dikulturkan, oleh karena itu diperlukan analisis yang mampu mengkaji keragaman bakteri endofit tanpa kultivasi yang dikenal dengan metagenomik. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui keragaman bakteri endofit pada buah tin serta gen prediksi yang bermanfaat pada bakteri endofit tersebut. Metode penelitian yang dilakukan merujuk pada analisis metagenomik ekstraksi DNA jaringan buah tin, amplifikasi gen 16s rRNA, elektroforesis, Next Generation Sequensing, dan di analisis menggunakan Operational Taxonomic Unit. Hasil keragaman bakteri endofit tingkat spesies yang diperoleh pada buah tin (Ficus carica L.) varietas Green Yordan adalah Weissella ghanensis, Weissella paramesenteroides, Ralstonia pickettii, Leuconostoc citreum, Pantoea stewartii, Gluconobacter cerinus, Lactococcus lactis.