Syafirna, Nadya Imannia (2025) AKTIVITAS INHIBISI BAKTERIOFAG HEPATOPANKREAS UDANG VANAME SEBAGAI STRATEGI INTERVENSI ACUTE HEPATOPANCREATIC NECROSIS DISEASE SECARA MOLECULAR DOCKING DAN IN VITRO. Undergraduate thesis, UNIMED.
4213220044_Cover.pdf
Download (141kB)
4213220044_Lembar_Pengesahan.pdf
Download (937kB)
4213220044_Abstrak.pdf
Download (469kB)
4213220044_Kata_Pengantar.pdf
Download (511kB)
4213220044_Daftar_Isi.pdf
Download (928kB)
4213220044_Daftar_Gambar.pdf
Download (238kB)
4213220044_Daftar_Tabel.pdf
Download (237kB)
4213220044_Daftar_Lampiran.pdf
Download (236kB)
4213220044_BAB_I.pdf
Download (1MB)
4213220044_BAB_II.pdf
Restricted to Repository staff only
Download (4MB)
4213220044_BAB_III.pdf
Restricted to Repository staff only
Download (2MB)
4213220044_BAB_IV.pdf
Restricted to Repository staff only
Download (1MB)
4213220044_BAB_V.pdf
Download (421kB)
4213220044_Daftar_Pustaka.pdf
Download (2MB)
4213220044_Lampiran.pdf
Restricted to Repository staff only
Download (6MB)
Abstract
Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi senyawa aktif pada supernatan bakteriofag hepatopankreas udang vaname, menganalisis interaksi inhibisinya terhadap reseptor Pir-A dan Pir-B melalui molecular docking, serta terhadap Vibrio parahaemolyticus strain AHPND secara in vitro. Sampel hepatopankreas diisolasi menggunakan media TSB, kemudian disaring dengan membran filter 0,45 dan 0,22 μl, selanjutnya supernatan bakteriofag dianalisis menggunakan LC-HRMS. Molecular docking dilakukan dengan PyRx dan divisualisasi menggunakan BIOVIA Discovery Studio 2021, sedangkan uji antibakteri dilakukan melalui metode spot test menggunakan media TSA antara supernatan bakteriofag dengan V. parahaemolyticus strain AHPND. Analisis menggunakan LC-HRMS berhasil mengidentifikasi 450 senyawa aktif. Hasil molecular docking menunjukkan bahwa 3-Cyclohexanesulfonyl-heptanoic acid hydroxyamide, D-Tryptophan, dan Butabarbital memiliki afinitas kuat terhadap reseptor PirA-like toxin (3X0T) dan PirB-like toxin (3X0U) dengan nilai binding affinity berkisar ≤ –6,4 hingga –7,6 kcal/mol. Interaksi dominan berupa ikatan hidrogen dan hidrofobik pada residu kunci TRP57, ASN87, ALA88, PHE89, dan TYR90 (PirA), serta TYR201, THR209, ASP216, ARG236, PHE244, MET247, GLN251, GLU289, dan ASP290 (PirB). Uji in vitro menunjukkan terbentuknya zona bening yang menandakan kemampuan supernatan bakteriofag menghambat pertumbuhan V. parahaemolyticus strain AHPND secara signifikan. Hasil ini mengindikasikan potensi supernatan bakteriofag hepatopankreas udang vaname sebagai agen biokontrol alami yang efektif untuk pencegahan AHPND dalam budidaya udang
| Item Type: | Thesis (Undergraduate) |
|---|---|
| Additional Information: | 639.48 Sya a |
| Keywords: | Bakteriofag, Litopenaeus vannamei, Vibrio parahaemolyticus, molecular docking, AHPND |
| Subjects: | Q Science > QD Chemistry > QD415 Biochemistry Q Science > QH Natural history > QH426 Genetics Q Science > QL Zoology > QL605 Chordates. Vertebrates > QL640 Reptiles and amphibians Q Science > QP Physiology |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Biologi |
| Depositing User: | Mrs Gusti Lisa Utami |
| Date Deposited: | 22 Jul 2026 03:16 |
| Last Modified: | 22 Jul 2026 03:16 |
| URI: | https://digilib.unimed.ac.id/id/eprint/67826 |
